国内外大量研究显示，剖宫产可能影响新生儿的生存能力，严重的会影响其近期和远期发育、智力等。这些已经引起国内外产科、儿科专家的普遍重视。剖宫产虽然一定程度上降低了围产儿的死亡率，但应正确认识剖宫产对下一代的影响不能盲目依赖。胎儿在发育成熟的情况下，“瓜熟蒂落”自然出生才是最健康的分娩方式。
剖宫产术对新生儿产生的近期影响有肺透明膜病变（RDS） ，剖宫产儿围产期RDS发生率是**产围产儿的两倍，且其病死率也明显高于**产儿。**分娩时由于产道挤压及儿茶酚胺调节使胎儿气道液体的1／3至2／3被挤出，为出生后气体顺利进入气道做准备，而剖宫产时缺乏这种过程，气道内液体潴留影响了通气和换气，易致窒息、湿肺、呼吸窘迫综合征、呼吸道感染等；新生儿高胆红素血症显著高于非剖宫产儿；影响新生儿神经系统，用新生儿2O项行为神经进行评定，发现剖宫产儿出生第7天和第14天评分低于自然分娩婴儿。
有学者认为，在自然分娩中由于胎头通过产道时受挤压发生变性，胎头娩出后血流量增加达到了脑的保护效应，剖宫产的新生儿没经过这一过程而影响了脑组织的成熟。
剖宫产术对婴儿的远期影响包括：对情商的影响，剖宫产出生的婴儿智商与**分娩比较无差异，但情商却低于**分娩儿，表现在人际交流，社会适应能力较差；过敏性哮喘发生率高于**分娩者，有学者专门做了远期随访，发现出生后到31岁时，剖宫产出生者过敏性哮喘的发生率3倍于**分娩者。
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