铁对于血红细胞的制造和大脑的发育都是十分重要的。如果婴儿缺铁，就可能导致儿童时期某些学习问题。所以，宝宝的饮食里一定要含有充分的铁质。母亲们常常认为加铁的配方奶中所含的铁会造成便秘，但是科学研究还没有发现相关的证据。而且，就算确有其事，高铁配方奶还是一定的重要性。有很多方法可以解决便秘的问题，但是缺铁造成的不良后果却是无法弥补的。
跟那些牛奶制成的配方奶比起来，豆类配方奶在有些方面对健康更有好处。有的小宝宝对牛奶配方奶里的蛋白质过敏，而这种奶粉也可能是宝宝哭闹的原因。还有一些研究指出，儿童糖尿病可能也跟牛奶中的蛋白质有关。
豆类配方奶里没有这些会带来问题的蛋白质，而且也没有乳糖一有的宝宝很难消化乳糖这种物质。虽然研究还没有证明豆类配方奶可以治疗婴儿肠痉挛，但是有父母反映，他们的宝宝对豆类配方奶的感觉明显要好。
另一方面，豆类配方奶也会带来健康上的危险。比如说，它们所含的铝往往过高。我们很清楚铝对身体是有害的，而且还会给早产儿带来严重的危害。虽然还没有研究证实豆类配方奶中的铝对足月的宝宝也会有危害，但是，被吸收的铝和老年痴呆症是有关系的(还有其他一些因素的作用)。有些科学家已经做出了推测，他们说豆类配方奶中的某些化学物质(植物雌激索)在罕见的情况下可能会干扰性器官的健康发育。虽然科学家对此并不肯定，但是他们至少掌握了足够的证据来提出这个疑问。
总而言之，两种配方奶粉都不是绝对理想的，这一点也再次印证了我们的观点只要有一点可能，母乳喂养都是很有价值的。对于有些宝宝和父母来说，一种奶粉的利弊可能会大于另一种。比如，要是新妈妈已经为孩子选择了低奶制品的饮食，那就应该选择豆类制成的配方奶。选择低奶制品是一个合理的方案。
许多父母都很关心牛奶蛋白过敏的问题。重度过敏是很容易发现的，它的症状包括腹泻、体重增长缓慢，以及干燥的刺激性皮疹。轻度过敏可能不容易察觉，因为大多数宝宝都会烦躁不安，也会不时地长点皮疹，这都与轻度过敏的症状很类似。家族性的牛奶过敏史是非常重要的线索。但是，大多数不能消化牛奶的成年人并不属于过敏，那只是因为他们分泌的酶(乳糖分解酵素)数量不足，无法分解牛奶中的主要糖分(乳糖)。虽然有些父母不能消化乳糖，但他们的宝宝大多数都能分泌足够的乳糖分解酵素。更复杂的是，许多对牛奶蛋白过敏的宝宝也会对大豆蛋白过敏。对这些宝宝来说，新妈妈可以使用那些不含牛奶蛋白或者大豆蛋白的特殊配方奶。这些配方奶最好在医生的指导下使用。
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