用于预防接种的疫苗都是安全的。然而，由于预防接种的目的是要让人体产生抵抗力，在刺激抵抗力产生的过程中，身体常会出现一些反应。一般说来，这些反应很轻微，时间很短暂，不会对身体产生大的危害。一般分为局部反应和全身反应。
局部反应：某些人在打预防针的第２～３天，注射部位出现红肿，并有疼痛。红肿一般有５分硬币大小，少数人红肿范围比墨水瓶盖还大一点，个别人甚至有鸡蛋大，腋下淋巴结可肿大。这些反应在２～３天内消退，很少持续４天以上。但卡介苗接种却例外，一般卡介苗接种后２～３周，接种部位出现花生大小的红肿硬结，随后中心部位逐渐软化，形成小脓疱．破溃后结痂，这个疤叫“卡疤”，是卡介苗接种成功的一种表现，整个过程要持续２～３个月。
全身反应：部分人在打预防针后发热，一般在３８℃左右，少数热度高一点，但很少超过３９℃后。在发热时，有些孩于不想吃奶，哭闹，或是打不起精神，要睡觉等，一般１～２天就好了。
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