大家都知道，接种疫苗可以让人获得对传染病的免疫力。但是，对免疫缺陷儿童来说，问题就不这么简单了。现在免疫缺陷疾病的种类和发病人数都在上升，如1952年只有6种，1998年不到60种，到2009年已超过200种。这类疾病各有特点，比如最多见的抗体缺陷病之一X-连锁无丙种球蛋白血症，我国患儿平均发病年龄是1.33岁，发病之前和正常的孩子完全一样，而诊断通常在更晚时才能明确(即便欧洲也要到5岁左右)。孩子如果在明确诊断之前接种减毒活疫苗，如在两个月时开始口服脊灰减毒活疫苗(OPV)，就可能出现风险。
对于存在免疫缺陷的孩子来说，接种脊灰减毒活疫苗可能会出现一些问题。如针对脊髓灰质炎病毒的免疫力不充分；或是出现对疫苗毒株的感染(严重者会瘫痪甚至死亡)；也有的人没有明显的临床表现，但是机体长期带毒，排泄到体外；有的人长期带毒，毒株不断发生突变，可能产生更强的毒株而危及周围健康人群。对于这部分孩子，应禁忌接种活疫苗，而选择脊髓灰质炎灭活疫苗(IPV)。这样接种后才没有病毒变异、毒性回升的危险。中国疾控中心发布的《脊髓灰质炎灭活疫苗使用指导意见》也指出，OPV仍是我国脊髓灰质炎免疫预防的首选疫苗；而对其禁忌者，特别是免疫缺陷者和正在使用免疫抑制剂者等可以优先考虑使用IPV。
在接种疫苗时应注意，已接种过OPV但未完成全程免疫的儿童，原则上不推荐使用IPV。如果部分使用IPV，建议第1、2剂次优先使用IPV，其余剂次用OPV，并按OPV的免疫程序完成全程免疫。由于目前许多免疫缺陷病无法早期诊断和筛查，因此对于存在反复肛周脓肿、反复出现各种较严重感染等免疫功能异常可能性较大的儿童，家长也可以按知情、自愿、自费的原则，选择注射型IPV。
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