新生儿除了卡介苗和乙肝疫苗，一般不需其他特殊的接种疫苗，但如果因为母亲染上疾病，可能对新生儿造成危害的话则需要特殊接种。
如果母亲是乙肝病毒携带者，在怀孕后三月最好注射乙肝高效价免疫球蛋白，新生儿出生24小时内注射第一次乙肝高效价免疫球蛋白和乙肝疫苗，以后第2、 3 个月也要注射乙肝高效价免疫球蛋白，第5 、6月也要注射乙肝疫苗，这样能够最大可能防止传染小孩。
如果妈妈感染人类免疫缺陷病毒（HIV），宝宝感染HIV后不会立即出现症状，但由于免疫力比较弱，由HIV发展成艾滋病的时间很短，因此，出生以后随时可能出现症状，出生后需要接受6周的抗艾滋病药物治疗，并不能进行母乳喂养。
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